ארגון חמאס מודה כי הפעולה הישראלית בבית החולים שיפא בעזה הייתה מכה קשה עבורו. בדיווח של העיתון "אל-אחבאר", המזוהה עם חמאס, נאמר כי "חדירה מודיעינית עמוקה" איפשרה לישראל לתפוס בכירים בארגון.
"איננו מקלים ראש בעומק החדירה המודיעינית", נכתב בדיווח. "חמאס ביצע רה-ארגון תוך התחשבות באפשרות שהאויב השיג מידע חדש ואיכותי שסייע לו בעזרת חקירת העצורים. מרכז העצבים של ההתנגדות עדיין במצב טוב, אך הארגון מודע לאבידות האחרונות."
