בעקבות פרסום זכייתו בפרס ישראל לספרות תורנית, הרב הראשי יצחק יוסף הודיע כי הוא מסרב לקבל את הפרס. בלשכת הרב הסבירו: "אילו היה ידוע לו על הגשתו כמעומד, היה פועל למנוע זאת. אין זו שנה מתאימה לטקסים ולחגיגות".
דבריו של הרב באים על רקע הסערה סביב התבטאותו האחרונה, בה אמר: "אם יגייסו חרדים, נרד מהארץ". בלשכת הרב הוסיפו באשר לסוגית הפרס: "ההוקרה היחידה של מדינה לאזרחיה היא שמירה על ביטחונם והוקרת החיילים המחרפים את נפשם בשדה הקרב".